Mancomún

DnaLinux, distribución para científicos

DNALinux é unha distribución GNU/Linux pensada para a comunidade científica. Desde a propia web pódense descargar novos paquetes de programas para actualizalos e personalizalos de forma única e adaptable en cada caso específico.

O proxecto era coñecido como BioShell, aínda que cambiou de nome para converterse no que hoxe coñecemos. Estaba baseada en [[SLAX]] pero con software para bioinformática. Na actualidade, atópase na súa versión 0.5 en forma de [[Live-CD]] baseado en Slax 5.06. Desta forma, a distribución pode ser  probada ou utilizada sen ningún risco de perda de datos. Tamén pode ser instalado como unha distro Linux normal.

 

A nova versión chamarase VDE (Virtual Desktop Edition) e será baseada en Xubuntu, a súa vez derivada de Ubuntu pero utilizando un escritorio livián (XFCE), en lugar de [[GNOME]] e [[KDE]].

Algunhas das aplicacións preinstaladas son:

  • 1.NCBI BLAST 2.2.16
  • 2.NCBI NetBLAST 2.2.16
  • 3.EMBOSS 4.1.0
  • 4.ESIM4 (EMBOSS SIM4)
  • 5.MSE 1.0.0
  • 6.Phylip 3.6b
  • 7.Biopython 1.43
  • 8.BioPerl
  • 9.Kalign 1.04
  • 10.Clustalx and Clustalw 1.83
  • 11.njplot
  • 12.Polyxmass 0.9.7
  • 13.Primer3
  • 14.Rasmol 2.7.2.1.1
  • 15.Sigma-align 1.0
  • 16.t_coffe 2.50
  • 17.xviewg
  • 18.Treeviewx 0.5.1
  • 19.hmmer 2.3.2
  • 20.NCBI-epcr
  • 21.Cn3D NCBI Database Viewer
  • 22.DDV Sequence Alignment Viewer
  • 23.Entrez NCBI Database Querying Tool
  • 24.OneD Biological Sequence Viewer
  • 25.PyMOL Molecular Graphics System
  • 26.Sequin DNA Sequence Submission Tool

Fonte: Territorio Libre

Xunta

Xunta de Galicia, Información mantida e publicada na internet pola Xunta de Galicia

Atención á cidadanía - Accesibilidade - Aviso legal - Mapa do portal